生物分類技能検定には、 生物が好きな一般の方を対象にした４級、３級、生物調査の専門家を対象にした２級（動物、植物、水圏生物の3部門）、さらなるプロフェッショナルを対象にした１級（上記3部門がさらに8専門分野に分かれます）が設置されています。
２級、１級の合格者は任意で登録が可能で、登録者は環境省の「一般競争（指名競争）参加資格申請」の有資格者として認められているほか、農水省、国交省や地方自治体等でも入札資格として取り入れられ、自然環境に関する調査・保全等の事業に不可欠な生物技術者として求められています。
また、近年ではメーカー等企業の生物多様性関連部門でも生物分類技能検定の有資格者が求められるなど、活躍の場がますます広がっています。